После загадочного исчезновения Элисон Холстон решает вопреки приказам начальства начать собственное расследование. Ему приходится скрытно собирать улики, чтобы понять, что именно случилось с его женой. В ходе своих поисков он обнаруживает серию нестыковок в официальных данных о внешнем мире и начинает сомневаться в правдивости информации, предоставляемой руководством бункера.
Холстон объединяется с другими жителями, которые тоже начинают подозревать, что их жизнь в бункере — не единственный вариант выживания. Эти люди, объединившись, начинают собирать группу сопротивления, чтобы узнать правду о внешнем мире и найти способ выйти за пределы бункера. Напряжение нарастает, и с каждым шагом Холстон понимает, что всё, во что он верил, может оказаться ложью.
Сезон заканчивается тем, что Холстон и несколько членов сопротивления решают рискнуть и выйти наружу. Последняя сцена — их первый шаг за пределы бункера, где они сталкиваются с неожиданным и шокирующим открытием, которое ставит под сомнение всё, что они знали о внешнем мире и их месте в нём.