Фильм переносит зрителей в далёкое будущее, где после гибели Цезаря и нескольких поколений обезьяны стали доминирующим видом на Земле. В то время как люди превратились в дикарей, утративших способность говорить, животные построили своё собственное общество. История сосредоточена на молодом шимпанзе по имени Ноа, который сталкивается с трагедией, когда его отец погибает, а все соплеменники попадают в плен к воинствующему прибрежному клану, возглавляемому высокомерным бонобо по имени Проксимус Цезарь.
Проксимус Цезарь одержим поисками старых человеческих технологий и использует своих пленников для достижения своих целей. Оставшись один, Ноа решает не оставаться в стороне и объединяет свои силы с орангутангом Ракой, который обладает глубокими знаниями и мудростью, а также с молодой женщиной по имени Мэй, сохранившей разум и речь, несмотря на упадок человеческой цивилизации. Мэй преследует собственные цели и скрывает некоторые важные секреты, которые могут изменить ход событий.
Вместе они отправляются в опасное путешествие, полное приключений и конфликтов, чтобы спасти соплеменников Ноа и предотвратить дальнейшие разрушения. Их пути переплетаются с древними технологиями и загадками прошлого, что приводит к напряжённым и драматическим моментам. «Планета обезьян: Новое царство» становится эпической историей о борьбе за свободу, выживание и поиске смысла в мире, где старые правила уже не действуют.